MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A plasmid pInt

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017242	TAT	2	6	18	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017242	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017242	TTA	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017242	CAT	3	9	181	189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017242	ATA	2	6	263	268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017242	A	6	6	268	273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017242	TA	3	6	1551	1556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017242	ATG	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017242	TA	3	6	1593	1598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017242	AAT	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017242	T	7	7	1625	1631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017242	TAG	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017242	TTA	2	6	1672	1677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017242	TA	3	6	1719	1724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017242	TGT	2	6	1742	1747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017242	TTTTA	2	10	1773	1782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017242	T	6	6	1796	1801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017242	T	6	6	1808	1813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017242	T	7	7	2251	2257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017242	A	6	6	2273	2278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017242	TAT	2	6	2298	2303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017242	TAT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017242	CATATA	2	12	2327	2338	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017242	TATT	2	8	2359	2366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017242	T	6	6	2365	2370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017242	TA	5	10	2373	2382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017242	ATT	2	6	2423	2428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017242	ATT	2	6	2434	2439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017242	A	6	6	2452	2457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017242	TTA	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017242	ATA	2	6	2464	2469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017242	AT	4	8	2472	2479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017242	TATAA	2	10	2488	2497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017242	TAA	2	6	2502	2507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017242	A	7	7	2514	2520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017242	AG	5	10	2526	2535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017242	ATATT	2	10	2537	2546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017242	T	8	8	2557	2564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017242	TTAT	2	8	2582	2589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017242	T	6	6	2731	2736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017242	T	7	7	2775	2781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017242	TA	3	6	2808	2813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017242	ATAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017242	ATT	2	6	2861	2866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017242	GATT	2	8	2885	2892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017242	A	6	6	3036	3041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017242	TAT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017242	CAG	2	6	3122	3127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017242	ATTT	2	8	3136	3143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017242	T	6	6	3141	3146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.